A、地域性原则。根据地理位置、气候特点、水体类型、功能要求、经济基础等因素，制定适当的水环境修复计划、指标体系和技术途径

B、生态学原则。根据生态系统自身的演替规律分步骤分阶段进行修复、并根据生态位和生物多样性原则构建健康的水环境生态系统

C、最小风险原则

D、最大效益原则