乙公司为从事印刷业务的企业（一般纳税人），甲地级市国税局在对乙公司进行检查时，发现该公司存在如下问题：
（1）乙公司通过销毁发票存根联、在账簿上多列支出或少列、不列收入等手段，共计少缴税款30万元，占应纳税额的20%。
（2）乙公司未按照规定的期限申报办理税务登记。
（3）乙公司曾为税务机关承印增值税专用发票。在完成印刷任务后，该增值税专用发票的印版仍暂保留在A公司手中，而未由税务机关收回。乙公司使用该印版私自印制增值税专用发票但尚未出售。
经税务机关核实，甲地级市国税局除责令其限期补缴少缴的税款30万元外，还依法对其罚款3万元。