在路基施工过程中，遇有下列原因使工期拖延：①业主拟将某段路基改为高架桥（处于关键线路上），在口头通知承包商两个月后才下发正式文件和变更图纸；②在土方开控（不处于关键线路上）过程中遇到了一些地质勘探没有探明的孤石；③6~8月份施工时遇到季节性降雨，雨量与往年相近；④在设计图纸中指明的借土场经取样试验，不能用于路基填筑（处于关键线路上），必须重找借土场，为此花费了7天时间。承包商就上述问题按政党索赔程序提出了延长工期及补偿停工期间窝工损失的申请。作为监理工程师，应如何处理？