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当前学科：生物信息学
题目：
问答题
什么是序列比对中使用的PAM矩阵和BLOSUM矩阵，它们的作用是什么，一般BLAST选择使用的矩阵是什么
答案：
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某市一建材公司下属城南水泥厂为了扩大生产，将其厂内原2.2m的窑径改为2.5m，没有进行环境影响评价，也没有“三同时”措施。同年7月，在没有经过环境保护部门对其环境保护设施进行验收的情况下，该厂便将改造过的生产设施正式投入使用，结果造成了污染影响。事后，市环保局经过调查，认为该公司的窑径改造项目既是扩大生产规模，又是改造生产设备和工艺的项目，根据《建设项目环境保护管理条例》第五条，“改建、扩建项目和技术改造必须采取措施，治理与该项目有关的原有环境污染和生态破坏”，而城南水泥厂投入生产后的烟尘浓度超过国家规定标准的14.26倍。同时，该条例第六条规定，建设项目必须实行环境影响评价，城南水泥厂也未执行。于是，市环保局于2000年12月19日对该公司作出罚款7万元的处罚决定。此案例发生在2000年，依据现在的标准，你认为该厂是否应该做出调整？若是，请说出调整项目。
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