前几年，为适应形势发展和机构改革的需要，某自治州委、州政府做出了合并该州传染病医院与结核病防治所的决定。但合并后不到半年，内部的矛盾就出现了：首先在经费上的矛盾。自合并以后，省结核病防治部门认为，合并后的结核病防治机构巳由原来的防疫性质变为了医疗性质，其防治费用的补助，应由地方财政按病床给予补贴；而地方财政认为，结核病防治应由省投资防治经费。由于省、州两家在经费问题上互相推威单位得不到应有的补助，致使工作受到影响。
其次，工作性质上的矛盾。医院是医疗性质，而结核病防治是防疫性质的，所以在经费、人力、物力、工作任务上都不便安排，上级下达的工作任务，特别是下达的结核病防治方面指令性的任务很难落实，省“结防”部门对此意见很大，医院的医务人员意见也很大。面对这种情况，医院的领导很为难，不合并吧，上级的决定又不能违反；合并吧，工作性质不同，内部的矛盾重重，在一个单位难以维持下去。鉴于这些情况，州卫生局对该院前段的工作进行了认真的总结，权衡利弊大于片，于是将情况及时向州委、州政府作了汇报，拿出了本局的意见，结果州委、州政府还是同意了州卫生局的意见，将合并的两个单位重新分开。分开后，各自的工作运转正常，事业上都有一定的发展。尽管这样人们还是担心，象这样的分分合合几时能休？