甲、乙双方当事人签订服装买卖合同，并在合同中约定了仲裁条款：凡因本合同所发生之一切纠纷，均提交某市仲裁委仲裁。后双方因纠纷将合同终止，甲方据该仲裁协议向仲裁委申请仲裁，乙方则向仲裁委提出异议，认为该仲裁协议已失效。同时乙向法院提起诉讼，请求判令合同仲裁条款无效。请回答下列问题。若本案最终以仲裁裁决的作出而结束，甲方申请人民法院撤销仲裁裁决，法院受理后，发现仲裁程序违法，遂通知仲裁庭重新进行仲裁，则：（）