A . 如行政机关对补偿作出决定，甲公司同时起诉的，法院可以决定合并审理
B . 对补偿问题，甲公司向行政机关提出申请，行政机关在法定期限内不予答复时，甲公司可向法院提起行政诉讼
C . 对甲公司的损失，应按照市场价值进行补偿
D . 对补偿问题，法院在审理时可以进行调解