原核生物只有一种RNA聚合酶而真核生物有三种，每一种都有某特定的功能。聚合酶I合成（），聚合酶II合成（），聚合酶III合成（）和（）。三种聚合酶都是具有多亚基的大的蛋白（）。有些亚基是各种聚合酶共有的，有些只是某种聚合酶才有。最大的亚基与（）的RNA聚合酶合同源。