2008年4月9日，某市质监局对该市某物资供应站进行执法检查时，发现该站销售的千禧龙牌塑钢门窗密封胶标称值380克、净重350克，标价3.5元一瓶。执法人员在现场8瓶样品中抽取4瓶，经社会公正计量行检测，净含量平均值为318克，平均负偏差为32克。该市局认定相对人违反了《商品量计量违法行为处罚规定》第三条，依据第五条予以责令改正、罚款2500元。请分析该案在查处过程中有什么主要问题？应当怎样处罚？